自動化：
　　成立于1958年，是國內首創的第一個自動化系。自動化系十分重視對學生創新能力的培養，要求學生具有堅實的數學和控制理論基礎，能熟練掌握和應用電子、計算機、現代通信技術，并鼓勵學生跨學科選修專業課程。高年級本科學生可以進入科研實驗室參加前沿科研項目研究，也可以利用暑期到北京自動化所、沈陽自動化所、合肥智能所、北京聲學所等科研單位參加大學生研究計劃。
計算機科學與技術：
　　是中國科技大學的強勢學科，不僅具有碩士、博士學位授予權，博士后流動站，而且具有增設二級學科的自主權。我國第一臺通用計算機——107機就是在這里誕生的。目前本學科所轄的計算機軟件與理論、計算機系統結構、計算機應用技術、信息安全四個二級學科均具有碩士、博士學位授予權，其中計算機軟件與理論是國家重點學科，系統結構是省重點學科。依托計算機科學與技術一級學科，中國科學技術大學還成為了教育部和國家計委批準的首批建立國家示范軟件學院的單位之一。
物理：
　　是中國科學技術大學1958年建校時最早設置的老系之一，目前物理系有物理學、應用物理學(凝聚態物理方向、微電子學與固體電子學方向)、光信息科學與技術三個本科生專業，其中凝聚態物理和光學還是國家重點學科。
　　有中科院量子信息重點實驗室、安徽省光電子科學與技術重點實驗室2個院省部級重點實驗室，并且是自然科學學術期刊《低溫物理學報》的所屬單位。物理系是國家理科基礎科學研究和人才培養基地及中國科學院博士生重點培養基地，畢業生中已有6人當選中國科學院或中國工程院院士。目前每屆本科畢業生約80%左右的同學在國內外著名學府繼續深造，由于專業基礎過硬，綜合素質高，物理系研究生畢業生受到相關用人單位的廣泛歡迎，就業地點多分布在北京、上海等大中型城市以及海內外經濟發達地區。南京大學重點優勢專業介紹 浙大重點優勢專業介紹